PATHQ--Quantum-Digital-Pathology-for-Whole-Slide-Image-Analysis/requirements.txt at main · Kabilash01/PATHQ--Quantum-Digital-Pathology-for-Whole-Slide-Image-Analysis · GitHub

1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
# PATHQ — Requirements
# Install order matters — run pip install commands in the README sequence

# ── Core ──────────────────────────────────────────────────────────────────
#torch>=2.3.0
#torchvision>=0.18.0
#torchaudio>=2.3.0

# ── Graph Neural Networks ──────────────────────────────────────────────────
torch-geometric

# ── Quantum Computing ──────────────────────────────────────────────────────
pennylane
pennylane-qiskit
qiskit
qiskit-aer

# ── Medical Imaging / Pathology ────────────────────────────────────────────
openslide-python
monai
torchstain
timm

# ── Data ───────────────────────────────────────────────────────────────────
medmnist
datasets
huggingface-hub

# ── XAI ────────────────────────────────────────────────────────────────────
grad-cam
qutip

# ── Experiment Tracking ────────────────────────────────────────────────────
wandb

# ── Scientific Computing ────────────────────────────────────────────────────
numpy
scipy
scikit-learn
Pillow
opencv-python

# ── Visualisation ──────────────────────────────────────────────────────────
matplotlib
seaborn

# ── Utilities ──────────────────────────────────────────────────────────────
tqdm
pyyaml